Eesti Raudtee jaamade struktuur koosneb väiksematest e. vahejaamadest, mis on kinnitatud suuremate e. tugijaamade juurde. Allpool on esitatud vahe- ja tugijaamade nimekiri koos telefoni- ja faksinumbritega.
Tartu piirkond
Nõmmküla, Tamsalu, Kiltsi, Rakke, Vägeva, Pedja, Jõgeva, Kaarepere, Tabivere, Kärkna, Reola, Vastse-Kuuste, Põlva, Veriora, Orava, Koidula, Ropka, Nõo, Elva, Palupera, Puka, Keeni, Sangaste, Valga, Karula, Antsla, Sõmerpalu, Võru, Lepassaare, Piusa
Piirkonna juhataja: +372 5063 816. jaamakorraldaja: +372 6158 444
Narva piirkond
Kadrina, Rakvere, Vaeküla, Kabala, Sonda, Kiviõli, Püssi, Kohtla, Jõhvi, Oru, Vaivara, Auvere, Soldina
Piirkonna juhataja: +372 5340 7039, jaamakorraldaja: +372 6158 603
Ülemiste-Tapa piirkond
Lagedi, Raasiku, Kehra, Aegviidu, Tapa
Piirkonna juhataja: +372 5263 797, jaamakorraldaja: +372 6158 216
Tallinna ja Lääne-Harju piirkond
Pääsküla, Valingu, Keila, Klooga
Piirkonna juhataja: +372 5800 5580, jaamakorraldaja: +372 6158 221
Muuga-Maardu jaamad
Muuga
Piirkonna juhataja: +372 5187 407, jaamakorraldaja: +372 6158 403
